การใช้ PCR ในการวินิจฉัยโรคติดเชื้อ
บทความนี้ จะกล่าวถึงเฉพาะการใช้ PCR ในการวินิจฉัยโรคติดเชื้อที่สำคัญ ผู้สนใจรายละเอียดในหัวข้อใด อาจค้นคว้าเพิ่มเติมได้จากเอกสารแนะนำข้างท้ายบทความ
แทบจะกล่าวได้ว่า ไม่มีจุลชีพทางการแพทย์ตัวใดเลย ที่จะไม่มีผู้ทำการศึกษาถึงประโยชน์ใช้สอยของ PCR ในแง่ต่างๆ สำหรับ clinical practice จะขอแบ่งการนำมาใช้ออกเป็นหมวดๆ ดังนี้
1. การวินิจฉัยการติดเชื้อในระบบประสาทกลาง
2. การวินิจฉัยวัณโรค
3. Multiplex PCR
4. Real-time PCR
การวินิจฉัยวัณโรค
จุดเด่นของการนำ PCR มาใช้ในการวินิจฉัยวัณโรคคือ ในรายที่ย้อมพบ acid fast bacilli (AFB) จากสิ่งส่งตรวจ สามารถใช้ PCR ตรวจยืนยันได้อย่างรวดเร็วว่า เป็น Mycobacterium tuberculosis หรือไม่ ส่วนในรายที่ AFB ได้ผลลบ PCR จะช่วยให้การวินิจฉัยวัณโรคเป็นไปได้อย่างรวดเร็วกว่าการเพาะเชื้ออย่างมาก
ในขณะนี้ องค์การอาหารและยาของสหรัฐอเมริกา (US FDA) ได้รับรองให้ใช้ commercial kit 2 รายการ สำหรับการ amplify nucleic acid เพื่อการวินิจฉัยวัณโรคจากเสมหะ คือ AMTDII (Enhanced Amplified Mycobacterium tuberculosis Direct Test, version II) ของ Gen-Probe? ซึ่งตรวจหา ribosomal RNA (rRNA) ของเชื้อ โดย isothermal amplification ของ RNA (แตกต่างจากการทำ PCR) โดยได้รับการรับรองจาก US FDA ให้ใช้ทั้งในเสมหะที่ smear positive และ negative โดยมี sensitivity และ specificity อยู่ที่ 90.9-95.2% และ 98.8-100% ตามลำดับ และ positive กับ negative predictive value อยู่ที่ 83.3-100% และ 98.4-99.6% ตามลำดับ อีกรายการคือ Amplicor® Mycobacterium Tuberculosis Test ของ Roche® Diagnostic Systems, Inc. เป็นการทำ PCR เพื่อ amplify DNA ของ M. tuberculosis ได้รับการรับรองให้ใช้ใน sputum ที่ smear positive เท่านั้น เนื่องจาก sensitivity ของ test ในราย smear negative ยังไม่ไวพอ
ส่วนการวินิจฉัยวัณโรค จากสิ่งส่งตรวจชนิดอื่นๆ นั้น ยังไม่ได้รับการรับรองจาก US FDA ถึงแม้ในทางปฏิบัติ จะมีการนำมาใช้ในทางคลินิกเพื่อตรวจหาเชื้อวัณโรคในหลายกรณี เช่น จาก pleural fluid หรือจาก CSF (ในขณะที่ CSF culture for TB ได้ผลบวกน้อยกว่า 10% ในคนไข้ TB meningitis) การศึกษาบางรายงานบ่งชี้ว่า การตรวจสองวิธีนี้ใน respiratory กับ extrapulmonary specimen ได้ผลใกล้เคียงกัน สำหรับการตรวจ CSF ใน TB meningitis ความไวที่ได้ แตกต่างกันตั้งแต่ 33-90.5% ขึ้นอยู่กับวิธีการที่ใช้ และ specificity มักจะมากกว่า 90% แต่คงต้องรอข้อมูลมากกว่านี้ ก่อนที่จะมีการยอมรับอย่างเป็นทางการ การแปลผล PCR ของแต่ละห้องปฏิบัติการ จึงต้องดูข้อมูลเฉพาะของสถานที่นั้นๆ ประกอบการตัดสินใจ