ในภาวะปกติร่างกายจะไม่มีตอบสนองทางภูมิคุ้มกันต่อแอนติเจนของตนเองหรือที่เรียกว่าภาวะ Self-Tolerance ความผิดปกติของการควบคุมระบบภูมิคุ้มกันนี้จะทำให้เกิดภาวะภูมิต้านทานต่อตนเองขึ้นได้ ในบทนี้จะกล่าวถึงกลไกของร่างกายที่รักษาภาวะ Self-Tolerance ไว้ ทฤษฎีต่างๆที่ทำให้ภาวะ Self-Tolerance เสียไปและก่อให้เกิดภาวะภูมิต้านเนื้อเยื่อของตนเองขึ้น รวมทั้งอธิบายถึงองค์ประกอบและกลไกทางภูมิคุ้มกันที่ก่อให้เกิดพยาธิสภาพในโรคภูมิต้านเนื้อเยื่อของตนเอง